Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAPBO95292 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms