Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATE1O95260 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms