Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms