Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-207ENST00000506810 817 ntTSL 37.15□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARHGAP21-220ENST00000638156 4034 ntTSL 57.12□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTLL7-204ENST00000472688 7969 ntTSL 27.12□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-211ENST00000566035 846 ntTSL 37.11□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FYN-228ENST00000524310 541 ntTSL 47.11□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-210ENST00000507303 875 ntTSL 37.1□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RALY-209ENST00000489384 227 ntTSL 37.1□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NPC1-206ENST00000587223 590 ntTSL 47.09□□□□□ -1.278e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-219ENST00000568481 582 ntTSL 37.06□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZRANB2-AS2-235ENST00000630885 558 ntTSL 57.05□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-204ENST00000561526 565 ntTSL 47.04□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RBM27-202ENST00000508019 453 ntTSL 37.04□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 LCLAT1-205ENST00000465538 560 ntTSL 57.03□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-209ENST00000586382 1022 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SEC14L1-220ENST00000588696 437 ntTSL 27.02□□□□□ -1.288e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.299e-8■■■■■ 107
SF3B1O75533 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLG2-207ENST00000581355 652 ntTSL 36.98□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLG2-202ENST00000577506 472 ntTSL 56.98□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BAIAP2-211ENST00000572918 626 ntTSL 46.98□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.298e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.96□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CPQ-202ENST00000517742 660 ntTSL 56.94□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 URGCP-204ENST00000439702 592 ntTSL 46.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP28-207ENST00000538475 1081 ntTSL 36.92□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.9□□□□□ -1.38e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IDE-206ENST00000478361 3198 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WDR59-206ENST00000562539 536 ntTSL 26.84□□□□□ -1.318e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHSY1-203ENST00000559384 139 ntTSL 36.8□□□□□ -1.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CALB1-203ENST00000473670 695 ntTSL 36.78□□□□□ -1.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TUSC3-212ENST00000511783 1203 ntTSL 56.77□□□□□ -1.328e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FKBP1A-208ENST00000474726 551 ntTSL 36.76□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-206ENST00000462684 1231 ntTSL 26.76□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SART3-211ENST00000548582 574 ntTSL 26.76□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-222ENST00000530373 785 ntTSL 56.76□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DHX57-202ENST00000452978 2559 ntTSL 56.75□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MTCL1-212ENST00000522146 580 ntTSL 46.75□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IPO11-208ENST00000506200 554 ntTSL 46.73□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CCDC144NL-AS1-204ENST00000437829 837 ntTSL 56.73□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.338e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SORT1-206ENST00000485149 442 ntTSL 36.71□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AFTPH-207ENST00000498706 4674 ntTSL 1 (best)6.7□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRAPPC11-206ENST00000509857 548 ntTSL 46.7□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 USP28-202ENST00000535607 683 ntTSL 36.67□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.348e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.353e-7■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CBWD2-208ENST00000479583 3305 ntTSL 26.62□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-208ENST00000518661 548 ntTSL 46.61□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 SAFB-212ENST00000592396 620 ntTSL 46.61□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-205ENST00000517639 425 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-210ENST00000518952 543 ntTSL 46.6□□□□□ -1.351e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 EIF4G3-203ENST00000374933 1136 ntTSL 56.6□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HDDC2-205ENST00000608456 624 ntTSL 36.6□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GLCCI1-204ENST00000438949 873 ntTSL 36.59□□□□□ -1.358e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 36.57□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNX13-210ENST00000494402 453 ntTSL 36.56□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SEL1L-202ENST00000554293 767 ntTSL 56.55□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RTFDC1-209ENST00000487211 411 ntTSL 36.55□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LSMEM1-204ENST00000471030 483 ntTSL 36.55□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DMXL2-212ENST00000560421 652 ntTSL 56.53□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNAP23-217ENST00000568451 573 ntTSL 46.52□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRI-207ENST00000486860 1024 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.378e-6■■■■■ 107
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1565.6 ms