Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F6O75461 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms