Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRAMEF2O60811 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF2O60811 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF2O60811 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRAMEF2O60811 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms