Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXA2O43364 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA2O43364 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms