Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF208O43345 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF208O43345 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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