Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCKDKO14874 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms