Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOC4-APOC2K7ER74 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms