Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GOLGA8SH3BPF8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms