Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms