Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MAP3K4Q9Y6R4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms