Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms