Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KNSTRNQ9Y448 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KNSTRNQ9Y448 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms