Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF8Q9UPP1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms