Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms