Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ABCC13Q9NSE7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms