Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC22A11Q9NSA0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms