Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REEP4Q9H6H4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
REEP4Q9H6H4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms