Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRRC2Q9BYS8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms