Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KRTAP2-4Q9BYR9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms