Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCGF6Q9BYE7 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms