Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BRIP1Q9BX63 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms