Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TRMT61BQ9BVS5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TRMT61BQ9BVS5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms