Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NUP58Q9BVL2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms