Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM79Q9BSE2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms