Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SH3GL3Q99963 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SH3GL3Q99963 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms