Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SFXN2Q96NB2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms