Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL15Q96M94 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL15Q96M94 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms