Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SGCZQ96LD1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms