Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COG3Q96JB2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms