Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF185Q96GF1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms