Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HERVK_113Q902F9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms