Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM46DQ8NEK8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms