Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
LINC00269Q8N2A0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms