Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNMB4Q86W47 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms