Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms