Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC80Q76M96 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms