Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
C16orf54Q6UWD8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms