Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD40Q6AI12 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms