Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM236Q5W0B7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM236Q5W0B7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms