Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZK1Q5T2W1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZK1Q5T2W1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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