Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms