Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC1Q4VXA5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC1Q4VXA5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms