Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms