Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC57Q2TAC2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC57Q2TAC2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms