Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UPP1Q16831 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms