Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NRF1Q16656 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRF1Q16656 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms