Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NTRK2Q16620 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTRK2Q16620 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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